米拉山前后均为高山草甸区，自然环境恶劣。米拉山段也是黑颈鹤、斑头雁、赤麻鸭等***保护动物的栖息地。在米拉山隧道项目施工过程中，施工方为了保护当地的自然生态环境，在隧道进出口设置了三级沉淀池，对隧道涌水进行沉淀后处理；采砂场的废水经三级沉淀后重复利用；砼拌合站污水设置三级沉淀池处理后利用施工降尘或绿化；施工营地建设排水系统，设置隔油池和沉淀池，沉淀处理后用于洒水降尘或绿化；施工中产生的建筑垃圾与生活垃圾进行集中收集，运***当地垃圾处理厂集中处置；施工场地、道路、便道及时进行洒水降尘；施工运输车辆进行了覆盖处理，防止运输过程中产生扬尘现象；对施工场地进行了全封闭围挡，以免对施工区域外的环境造成破坏。“除了这些措施外，我们还在工程施工的地方，将高原草甸集中堆码、定浇水养护，以便后绿化或移植***地表裸露处。”刘金杰介绍道。
据介绍，米拉山隧道项目在施工过程中，不会对国道318线限行，在需要修建路基、挡墙的地方，会临时开设便道，供过往车辆通行。国道318线拉林高等级公路是西藏自治区公路网主骨架的重要组成部分，也是西藏“十二五”公路交通规划中调整的重点项目之一，该项目的建设完成对巩固国防，促进沿线经济社会发展，改善少数民族地区生产、生活条件等具有十分重要的意义。